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押井守はインタビューや関連書籍にて、この映画に関して「究極の身体論」を語っている。バトーとトグサが捜査の中で出会う多くの人物達は、天才クラッカーから少女に至るまで、それぞれに身体に対する確固たる哲学や主張を持っており、引用がちりばめられた会話によって身体論は複雑になっていく。だが、どの主張も一見して筋が通っている反面、理論はそれぞれの個人的感情を越えるに至っていない。他者の思想を肯定することも否定することもできないまま、主人公であるバトーにも答えは見出せず、ただひたすらに個人的な葛藤や職務と戦い続けるばかりである。バトーが「守護天使」と呼んで特別な感情を抱いている草薙素子との数少ない会話においても、「個人を超越してしまった存在である素子という他者」という定義の難しい存在とのつながりへの淡い期待が残る程度であり、それによってバトーの心が救われたかどうかは最後まで定かでない。しかし、押井守が監督した映画の中で、ここまで主人公が他者への期待や依存を露わにする場面も珍しいとも言え、それは押井が常に映画の中で疑いを投げかけてきた「巨大であやふやな他者」への仄かな期待と受け取れるかもしれない。
また、脳刺激療法では患者の本来の性格を変えてしまいかねないという倫理的問題もある。素材そのものに対する危険性も否定できない。現段階では体内インプラントRFIDチップに発ガンの危険性が指摘されている。[7]これらの技術は人間の尊厳を犯す可能性が指摘されており、研究者達は倫理的な面でも議論を進めている[6]。アメリカ合衆国では、サイボーグ技術の軍事利用への研究もDARPAを中心にして活発に行われている[6]。兵士の身体能力を大きく強化する、戦闘において手足を失った兵士に義手義足を適用し素早く戦場復帰を行わせる、戦闘機パイロットの脳に各種センサーと戦闘機のコントロール機能を接続し、その能力を大幅に強化したりする（これを「ブレイン・マシン・インタフェース」という。）ことなどが考えられている。
上記に述べたハッカーの表記においては、国際的に様々な場で「本来の意味」が問われる事がある。しかしながらこうした討論を巻き起こすのは、実際にはハッカーでも何でもない自称ハッカー（往々にしてスクリプトキディやニュービーである事が多い）であり、また多くの場合この論議は、技術者をハッカーとクラッカーに二分した主観において行われ、実際に犯罪性を持つ事件と関わった人物の立場を考慮する事が行われない点においても、そうした討論自体が無駄であるという声も高い。日本において名の通ったアリス・リデルは自著の中で「自分はハッカーではない」と述べるが、アリス・リデルを取り巻く様々な人々からはハッカー、クラッカー、スクリプトキディ、荒らし等、様々な呼ばれ方をしているケースなど、良い事例である。また、「How To Become A Hacker」(ハッカーになるための方法)の著作者であるエリック・レイモンドによると、「ハッカー」とは何かを創造するものであり、クラッカーとは何かを破壊するものであるとのこと。また、「ハッカー」であることを声高に名乗るものほど「クラッカー」である可能性が高いとも語っている[1]。
2007年11月17日、TBSラジオ『コサキンDEワァオ』にゲスト出演した際、新婚間もない頃、妻のカレーライスを食べて「もっと具が多いカレーが好きなんだけどなぁ…」と言って以来、一度も家でカレーを作ってくれなくなった事がリスナー情報により発覚した。小堺との舞台『不定期ライブマン★コミック君!』にて2006年に離婚していたことを公表。2007年11月24日の公演では、かないが観客として来ている前で離婚ネタを披露している。離婚した現在も『それいけ!アンパンマン』で、共演している。